8 месяцев назад
История
README.md
РАСЧЕТНЫЙ СЕРВЕР
Для проведение квантово-химических расчетов организована возможность выполнять задачи на вычислительном сервере.
Сервер в формате 2U на платформе Supermicro.
| Спецификации | Доступное ПО |
|---|---|
| CPU Xeon E5-2680 v4, 14 ядер 2.4-2.9 ГГц (x2) | GAMESS-US 2022 (R2) 64-bit |
| RAM DDR4 128 ГБ ECC REG | Gaussian 16 2019 |
| HDD SAS 4 TB (x2) RAID0 | FireFly 8.2 32-bit |
| OS Ubuntu 22.04 LTS | VASP 6.2.1 (в процессе запуска) |
ИНСТРУКЦИЯ
Для выполнения расчета вам необходимо отправить готовый входной файл на адрес shurygin.av@dvfu.ru в теме письма указать «Расчет на сервере».
Для всех программ существуют ограничения и особенности запуска.
Для GAMESS-US:
- Расчет выполняется на 14 ядрах (проблемы с mpich)
- MWORDS неограничен, но для систем >300 атомов возможны проблемы при расчетах TD-DFT
- Если в расчете используется внешний базисный набор, его необходимо высылать вместе со входным файлом
Для Gaussian:
- Расчет выполняется на 28 ядрах (%CPU=0-27)
- Память ограничена 96 ГБ (%mem=96GB)
- При расчетах рекомендуется указывать временный файл (%chk=/tmp/file_name.chk)
- Объем временных файлов ограничен 1 ТБ, после успешных расчетов временные файлы удаляются и если они нужны, необходимо об этом сообщить и подготовить внешний HDD
Для FireFly:
- MWORDS ограничен 268, особенности самого FireFly
- Возможны любые проблемы в процессе запуска
Для VASP:
- В процессе настройки
- …
Полученные выходные файлы высылаю ответным письмом.
Если объем выходных файлов высок - передам на внешнем HDD.
██████
██ ██
██ ██
▒▒▒▒ ██
██████ ▒▒▒▒ ██ ████████
██ ████ ██ ██ ████ ██
██ ██████ ████ ██
██ ████ ████ ██
██ ██ ██ ██ ██ ██
██ ██ ██████ ██ ██
██ ██ ██ ██ ██ ██
██ ████ ████ ██
██ ████ ▒▒▒▒▒▒ ██ ██
██ ██ ▒▒▒▒▒▒ ████
██ ██ ▒▒▒▒▒▒ ██ ██
░░░░ ████ ████ ██
░░░░ ██ ██ ██ ██ ██
██ ██ ██ ██ ██ ██
██ ██ ████ ██ ██ ██
██ ████ ██ ██
██ ██████ ████▒▒▒▒ ██
██ ████ ██ ██ ▒▒▒▒██ ██
██████ ██ ██ ████▓▓
██ ██
██ ██
██ ██
██████
Конвейеры
0 успешных
0 с ошибкой